平果校区图书馆下设七个部门：采编室、外借室、报刊阅览室、电子阅览室、音像资料室与技术部办公室、过刊室、学生自习室。

采编室（一楼）负责采购图书资料，并进行分类编目，建立与维护数据库。

外借室（三楼）面积491平方米，主要负责图书流通及借书证办理等工作，同时还担负着典藏、管理中文书刊文献资料。目前平果校区图书馆馆藏图书约有15000多册。

报刊阅览室（二楼）面积276平方米，内设桌椅，可供120人同时阅览。现有期刊杂志约300多种，报纸约40余种，包含文化、教育、政治、英语、艺术、兼课等多个方面，为全校师生提供过刊外借和新刊内阅服务。

电子阅览室（二楼）是为适应图书馆工作信息化、网络化、数字化发展趋势而成立的业务部门，主要提供电子出版物及互联网信息资源的阅览，目前正在建设中。

音像资料室与技术部办公室（二楼）用于存放光盘、电子资料等各种音像资料，想学啥提供视、听欣赏服务，目前处于筹备阶段。

过刊室（一楼）用于存放报刊，过刊及进行过刊借阅服务。

学生自习室（二楼）目前共设2个，为全校师生提供学习场地，可供约400人同时进行学习。